独立行政法人通則法に基づく独立行政法人。
JASSOは日本育英会、財団法人日本国際教育協会、財団法人内外学生センター、財団法人国際学友会、財団法人関西国際学友会が合併して2004年4月1日、設立された。

事業費を対象とした日本学生支援機構への寄付金は、税法上、特定公益増進法人への寄付金となる。又、学費の貸与を目的とした当該法人への寄付金は、指定寄付金とされ課税対象外となる。

JASSOの目的は、上記の団体が個別に行ってきた日本人学生への奨学金貸与事業、留学生に対する奨学金の給付事業や学生生活調査などの学生支援事業を総合的に実施する機関とされている。